Bên cạnh những gì đã đạt được, công tác tuyên truyền phòng, chống ma túy cũng gặp không ít những khó khăn và bất cập khi triển khai tại các trường học. Điều này khiến nhiều giáo viên cảm thấy lo lắng về hiệu quả và tính bền vững của nó, đặc biệt là khi chưa có tài liệu thống nào về phòng, chống ma túy cho cộng đồng.