Bộ GTVT thừa nhận có 17 trạm có bất cập về vị trí nhưng vẫn kiến nghị giữ nguyên nhiều trạm thu phí như hiện nay; nếu không, ngân sách sẽ phải bù hàng chục nghìn tỉ đồng cho các nhà đầu tư. Trong đó, “nặng nhất” chính là dự án cao tốc Hà Nội - Hải Phòng, nếu bỏ trạm BOT trên QL5, nhà nước phải bù 16.